Spoločnosť Swift ponúka metódu prípravy knižnice s najvyššou priepustnosťou na báze metylačného bunkového sekvencovania
Štúdia publikovaná v časopise Science demonštruje, ako dokážu epigenetické markery identifikovať bunkové podtypy a regulačné prvky, ktoré stoja v pozadí rôznorodosti buniek
ANN ARBOR, Michigan, 11. augusta 2017 /PRNewswire/ -- Spoločnosť Swift Biosciences, popredný poskytovateľ inovatívnych riešení na prípravu knižníc pre sekvencovanie novej generácie (NGS), dnes oznámila spustenie novej metódy metylačného bunkového sekvencovania pomocou technológie Accel-NGS® Adaptase™, efektívneho a robustného NGS-prípravného riešenia pre bisulfitové sekvencovanie celého genómu pri rozlíšení na úrovni bunky. Táto nová metóda umožňuje efektívnu analýzu rôznych metylovaných oblastí v tisícoch buniek z heterogénnych tkanív, ako aj klasifikáciu buniek, reguláciu bunkových mechanizmov v normálnom tkanive, epigenetické zmeny v chorobných stavoch a evolučnú ochranu epigenomickej regulácie.
Metylácia je stabilný biomarker použiteľný na identifikáciu bunkových typov a regulačných prvkov, ktoré sú základom bunkovej funkcie. Keď sa spojí so štúdiami bunkovej expresie RNA, metylácia bunky môže objasniť regulačné prvky, a tak riadiť jedinečné profily expresie jednotlivých buniek a rozdiely medzi bunkami. Navyše nedávne klinické štúdie odhalili spôsoby metylácie pri ochoreniach, ako je rakovina, ktoré identifikujú typ nádoru, hodnotia nádorové zaťaženie v tekutých biopsiách a korelujú ho s progresiou ochorenia, prognózou a reakciou na liečbu.
Táto metóda bola nedávno opísaná v článku v časopise Science s názvom „Bunkové metylómy identifikujú neurónové podtypy a regulačné prvky v mozgovej kôre cicavcov" kolektívom odborníkov zo Salk Institute Kalifornskej univerzity v San Diegu a Swift Biosciences. Pracovný postup spája izoláciu založenú na triedení na báze fluorescencie, konverziu bisulfitu a modul Swift Accel-NGS Adaptase s inými komerčne dostupnými komponentmi. Publikované výsledky preukázali viac ako dvojnásobný nárast miery mapovania a čítania v porovnaní s inými metódami, čím sa výrazne zvyšuje kvalita výstupných dát na jednu sekvenciu a znižujú celkové náklady.
„Jedná sa o jednu z mnohých vedeckých prác, v ktorej spoločnosť Swift technológie posúva hranice vedy," povedal Timothy Harkins, prezident a generálny riaditeľ spoločnosti Swift Biosciences a spoluautor článku. „Sme nadšení z nových poznatkov o základných bunkových procesoch a z vyhliadok, ktoré má táto technológia v rámci budúcnosti presných lekárskych postupov."
„Naša vlastná technológia Adaptase konštruuje sofistikované NGS knižnice z jednovláknových DNA s nízkym vstupným množstvom," povedala Laurie Kuriharová, PhD, vedúca pracoviska výskumu a vývoja a spoluautorka článku. „Náš postup pri práci s bunkou obsahuje menej krokov než iné metódy a ponúka viacnásobné spracovanie jedinej bunky, ktoré poskytuje vyššiu produktivitu pre aplikácie s vysokou priepustnosťou."
Modul Accel-NGS Adaptase je teraz komerčne dostupný.
Related Links
WANT YOUR COMPANY'S NEWS FEATURED ON PRNEWSWIRE.COM?
Newsrooms &
Influencers
Digital Media
Outlets
Journalists
Opted In
Share this article