Společnost Swift oznamuje metodu přípravy sekvencování jednobuněčné methylace s nejvyšší propustností
Studie publikovaná v časopise Science ukazuje, jak mohou epigenetické markery identifikovat buněčné podtypy a regulační prvky, které podporují buněčnou různorodost
ANN ARBOR, Michigan, 12. srpna 2017 /PRNewswire/ -- Swift Biosciences, přední poskytovatel inovativních řešení pro přípravu knihoven pro sekvencování nové generace (NGS), dnes oznámila zavedení nové metody sekvencování jednobuněčné methylace, která je založena na její technologii Accel-NGS® Adaptase™, což je účinné a robustní řešení přípravy NGS pro hydrogensiřičitanové sekvenování celého genomu při jednobuněčném rozlišení. Tato nová metoda umožňuje efektivní analýzu různých methylovaných oblastí tisíců buněk z heterogenních tkání, přičemž se také zabývá aplikacemi, jako je klasifikace buněk, regulace buněčných mechanismů v normální tkáni, epigenetické změny v chorobných stavech a evoluční ochrana epigenomické regulace.
Methylace je stabilní biomarker, který může být použit k identifikaci buněčných typů a regulačních prvků, které jsou základem buněčné funkce. Při spojení se studiemi exprese jednobuněčného RNA může jednobuněčná methylace vyjasnit regulační prvky a zároveň sledovat specifické profily exprese jednotlivých buněk a rozdíly mezi buňkami. Navíc nedávné klinické studie odhalily vzory methylace v onemocněních, jako je rakovina, které identifikují typ nádoru, posuzují nádorovou zátěž v tekutých biopsiích a korelují s postupem onemocnění, prognózou a reakcí na léky.
Tato metoda byla nedávno popsána v dokumentu vydaném v časopise Science s názvem „Single Cell Methylomes Identify Neuronal Subtypes and Regulatory Elements in Mammalian Cortex" (Jednobuněčná methylace identifikuje neuronální podtypy a regulační prvky v kortexu savců), vydaném spolupracujícími odborníky z institutu Salk Institute, Kalifornské univerzity v San Diegu a společnosti Swift Biosciences. Pracovní postup spojuje izolaci založenou na třídění fluorescenčně aktivovaných buněk, konverzi bisulfitu a modulu Accel-NGS Adaptase společnosti Swift s dalšími komerčně dostupnými komponenty. Zveřejněné výsledky prokázaly více než dvojnásobné zvýšení míry mapování ve srovnání s jinými metodami; tím se výrazně zlepšuje výstup dat při sekvenování a snižují celkové náklady.
„Jedná se o jednu z mnoha vědeckých spoluprací, ve kterých technologie společnosti Swift posunují hranice vědy," řekl Timothy Harkins, prezident a generální ředitel společnosti Swift Biosciences a spoluautor tohoto dokumentu. „Jsme nadšeni novými poznatky o procesech základních buněk a hlubokým budoucím dopadem na přesné lékařství."
„Naše patentovaná technologie Adaptase vytváří knihovny NGS s vysokou složitostí z DNA s nízkou vstupní hodnotou," uvedla Laurie Kurihara, PhD, ředitelka výzkumu a vývoje a spoluautor uvedeného dokumentu. „Náš pracovní postup jednobuněčné metody má méně kroků než jiné metody a nabízí multiplexní zpracování jednotlivých buněk, což poskytuje vyšší produktivitu při aplikacích s vysokou propustností."
Modul Accel-NGS Adaptase je nyní komerčně dostupný.
Related Links
WANT YOUR COMPANY'S NEWS FEATURED ON PRNEWSWIRE.COM?
Newsrooms &
Influencers
Digital Media
Outlets
Journalists
Opted In
Share this article